Stasiun Karantina Pertanian Kelas II Tanjung Balai Karimun merupakan Unit Pelaksana Teknis (UPT) lingkup Badan Karantina Pertanian yang dibentuk berdasarkan Peraturan Menteri Pertanian Nomor 22/Permentan/OT.140/4/2008 Tanggal 23 April 2008 tentang Organisasi dan Tata Kerja Unit Pelaksana Teknis Badan Karantina Pertanian.
Berdasarkan Peraturan Menteri Pertanian Nomor 22/Permentan/OT.140/4/2008 tersebut maka Wilayah Kerja Karantina Hewan Tanjung Balai Karimun dari UPT Stasiun Karantina Hewan Kelas II Tanjung Pinang terintegrasi dengan Wilayah Kerja Karantina Tumbuhan Tanjung Balai Karimun dari UPT Stasiun Karantina Tumbuhan Kelas II Tanjung Pinang menjadi Unit Pelaksana Teknis (UPT) sendiri yang menjalankan Tugas Fungsi Karantina Hewan dan Tumbuhan sekaligus berfungsi sebagai pelebaran pelayanan operasional pengawasan keamanan hayati hewan dan tumbuhan.
Nilai-nilai :
- Religius
- Beramanah
- Kerja keras
- Kebersamaan
- Keadilan dan Kesetaraan
- Transparan dan Akuntabel
- Komunikatif
